O Litoral Norte tem nove praias inadequadas para banho no fim de semana, segundo a Cetesb. Ilhabela registra o maior número de praias poluídas, quatro, entre elas, as badaladas praias do Curral (Foto), Veloso, Portinho e do Julião. Em Caraguatatuba, duas praias das mais frequentadas também estão poluídas: Tabatinga, próximo ao rio e a Prainha.
Em Ubatuba, segundo a Cetesb, apenas a praia do Itaguá está imprópria para banho em dois pontos, as demais apresentam boas condições para banho no fim de semana. Em São Sebastião, estão poluídas a Prainha e a Preta do Norte. As praias da costa sul estão todas em boas condições de uso.
As praias classificadas como impróprias pela Cetesb são sinalizadas com bandeira de cor Vermelha e devem ser evitadas para banho de mar devido ao risco de doenças transmitidas pelo esgoto presente na água do mar. As praias liberadas para banho são sinalizadas com bandeiras de cor Verde.
A Cetesb realiza desde 1974 o monitoramento das principais praias do Litoral Norte. Atualmente, no Litoral Norte são monitorados 97 pontos em 83 praias da região. Algumas praias, como Itaguá, em Ubatuba; Tabatinga, em Caraguatatuba; Maresias e Juquehy, em São Sebastião, a Cetesb avalia as condições do mar em dois setores das praias, normalmente, próximo aos rios que desembocam nessas praias e no meio das praias.